Praxisbeispiel: Biomerieux Vitek Antibiogramm ins LIMS importieren


Ein Antibiogramm ist das Ergebnis eines Labortests zur Bestimmung der Empfindlichkeit bzw. Resistenz von mikrobiellen Krankheitserregern gegenüber Antibiotika. Mit dem Labordatenbank LIMS können Sie mit Hilfe definierter Importschnittstellen die Antibiogramme Ihrer bestehenden Analysegeräte direkt anbinden.
Im Folgenden geben wir Ihnen eine Schritt-für-Schritt-Anleitung zum automatischen Ergebnisimport von einem Biomerieux Vitek Analysegerät in Ihr Labordatenbank LIMS System. Mit der Schnittstelle werden sowohl MHK-Werten als Ergebnisse importiert.

Legen Sie zunächst Ihre Antibiogramm-Parameter an:



Verwenden Sie dabei folgende Struktur:

Importschlüssel: Abkürzung aus der Vitek Datei
Spalte 0: MHK-Wert
Spalte 1: Ergebnis




Legen Sie eine neue Importschnittstelle an

Geben Sie den Namen der Importschnittstelle ein und hinterlegen Sie die Eigenschaften der Exportdatei:

Hinweis: Biomerieux gibt die Exportdatei zwar mit der Endung .xml aus, der Inhalt ist jedoch kein XML. Wählen Sie daher Typ CSV und als Trennzeichen Pipe aus.



Wählen Sie den Importmodus update sowie als Parameterimportschlüssel die gleichnamige Auswahl und laden Sie eine Testdatei rein



Bevor Sie die Biomerieux Exportdatei mappen können, ist noch eine Umwandlung mit Transformationsskript nötig. Das Skript können Sie sich erstellen lassen oder Sie erhalten es von Ihrem Labordatenbank Kundenbetreuer.



Im folgenden Schritt können Sie festlegen, welche Daten aus der Datei in die Labordatenbank übernommen werden sollen (Importmapping). Bestimmen Sie selber, welche Rohdaten Sie in Ihr Labordatenbank LIMS importieren möchten - z.B. mit oder ohne MHK-Werte.



Legen Sie nun eine Probe mit Antibiogramm-Parametern an:



Speichern Sie das Importmapping:



Scannen Sie im Vitek die Probenummer ein und warten Sie, bis die Datei automatisch in die Labordatenbank importiert wird. Alternativ können Sie die Datei auch unter Menüzeile -> Proben -> Importschnittstellen hochladen.



Die Werte werden nun automatisch importiert:



Allgemeines

Einf?hrungsphase

Mitarbeiter

Auftr?ge

Proben

Probenvorlage

Berichte

Berichtstabellen Editor

ADM

Kunden

Kundenzone (optional)

Anlagen

Rechnungen

Parameter

Rechnen mit Parametern

Schnittstellen

Webservice

Pr?fpl?ne / Grenzwerte / Spezifikationen

Dokumentenlenkung

Pr?fmittel

Material

Mitarbeiterschulungen

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Sonstiges

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Auswertungen